Genomika i proteomika roślin 04-BIO-AG-GIPR-SD2
Wykłady:
Techniki mapowania genomów (mapy fizyczne, genetyczne, restrykcyjne), genomika funkcjonalna (poznanie funkcji genów w genomie; techniki analizy ekspresji genów i ich wygaszania), genomika strukturalna (struktura genomów, techniki analizy mutacji pojedynczego nukleotydu), genomika teoretyczna (ogólne prawa rządzące genomami), genomika porównawcza (ewolucja genomów; filogenetyka molekularna), genomika indywidualnych różnic (zmienność międzyosobnicza genomów tego samego gatunku), ochrona roślinnych zasobów genowych. Elementy proteomiki, transkryptomiki i metabolomiki. Inżynieria białkowa w biotechnologii.
Ćwiczenia:
Wyszukiwanie informacji w biologicznych bazach danych. Porównywanie sekwencji DNA (programy BLAST, Clustal). Projektowanie starterów do reakcji PCR, analiza restrykcyjna, dobór enzymów do PCR-RFLP. Analiza sekwencji DNA (wyszukiwanie genów, promotorów, miejsc splicingu, wysp CG, znajdowanie potencjalnych miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych). Analiza sekwencji aminokwasowej – wyszukiwanie domen, modelowanie struktury białek. Porównanie sekwencji białek.
Koordynatorzy przedmiotu
Literatura
Literatura podstawowa:
1. T. A. Brown. Genomy. PWN, Warszawa 2009
2. S.B. Primrose. Zasady analizy genomu. WNT, Warszawa 1999
3. W.M. Karłowski. Genomy roślinne: wybrane metody poznania i analizy. Wydawnictwo Naukowe UAM, Poznań 2006
4. P. G. Higgs, T. K. Attwood. Bioinformatyka i ewolucja molekularna. PWN, Warszawa 2008
5. źródła internetowe
Literatura uzupełniająca:
1. J.D. Watson, A. Berry. DNA. Tajemnica życia. Wydawnictwo W.A.B. Warszawa 2005
2. J. Buchowicz. Biologia molekularna. PWN, Warszawa 2007
3. A.D. Baxevanis, B.F.F. Ouellette. Bioinformatyka. PWN, Warszawa 2005
4. J.D. Watson, M. Gilma, J. Witkowski, M. Zollem. Recombinant DNA. Scientific American Books 1996
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: