Biotechnologia drobnoustrojów 04-BIO-BPZ-BIOTD-SP5

Wykłady:
Wykorzystanie metod biologii molekularnej (PCR) do wykrywania i identyfikacji grzybów, w tym patogenów roślin, badania ich zmienności - podstawy metody PCR i techniki oparte na tej metodzie. Oddziaływania biotyczne między mikroorganizmami, zastosowanie właściwości fungistatycznych mikroorganizmów w ochronie roślin i produkcji biopreparatów. Podstawowe produkty przemiany materii drobnoustrojów i ich znaczenie dla przemysłu. Produkcja kwasu cytrynowego przez grzyby. Biokatalizatory i ich zastosowanie w technologiach przemysłowych, biokatalizatory immobilizowane i metody ich unieruchamiania. Substancje chemiczne stosowane w rolnictwie – wpływ na równowagę biologiczną (drobnoustroje i środowisko). Mikoryzy - ich fizjologiczne podłoże oraz znaczenie w przyrodzie i gospodarce człowieka. Endofity – wykrywanie i znaczenie gospodarcze.

Ćwiczenia:
Metody izolacji DNA. Izolacja genomowego DNA grzybów patogenicznych. Pomiar ilości DNA w wyizolowanych próbkach i przygotowanie materiału do dalszych badań techniką PCR, obliczanie stężeń, przygotowywanie mieszaniny reakcyjnej i programowanie termocyklera, elektroforeza na żelu agarozowym, analiza wyników. Weryfikacja przynależności gatunkowej badanych izolatów grzybów patogenicznych metodami molekularnymi (PCR). Identyfikacja mikroorganizmów odpowiedzialnych za tworzenie metabolitów wtórnych (analiza obecności i funkcjonalności niektórych genów klasteru Tri przez grzyby mikotoksynotwórcze (analiza chemotypów). Metody identyfikacji endofitów w materiale roślinnym. Oddziaływania pośrednie i bezpośrednie między grzybami (antybioza). Poszukiwanie szczepów grzybów o silnych właściwościach antagonistycznych - test biotyczny - weryfikacja zdolności różnych izolatów Trichoderma i Gliocladium do ograniczania rozwoju patogenów. Wpływ substancji chemicznych (środki dezynfekcyjne, pestycydy, antybiotyki) i czynników fizycznych (światło o różnym zakresie fal, temperatura) na wzrost drobnoustrojów.