Bioinformatyka 06-BIO-DM-BIOI-SD1
Wykłady:
Wprowadzenie do bioinformatyki. Bioinformatyczne bazy danych. Genomika strukturalna – wprowadzenie. Genomika funkcjonalna - wprowadzenie. Analiza struktury DNA i RNA. Przewidywanie regionów kodujących w genomach zwierząt. Analiza sekwencji białek. Analizy filogenetyczne – etapy, modele, programy dostępne w Internecie.
Ćwiczenia:
Pobieranie informacji z biologicznych baz danych i ich przetwarzanie. Archiwa czasopism naukowych dostępnych on-line. Programy do podstawowej analizy w bioinformatyce. Analiza struktury DNA i RNA. Identyfikacja genów oraz porównawcza i eksperymentalna analiza genomów. Porównanie sekwencji. Projektowanie starterów oligonukleotydowych. Techniki stosowane w analizie ekspresji genów. Przewidywanie struktury białek. Zastosowanie programów komputerowych do analizy filogenetycznej.
Koordynatorzy przedmiotu
Literatura
Literatura podstawowa:
1. A.D. Baxevanis (red.), B.F.F. Ouellette (red.), “Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek”, PWN, 2005
2. Brown T.A., “Genomy”, PWN, 2001.
3. Higgs P.W., Attwood T.K., „Bioinformatyka i ewolucja molekularna”. PWN, 2008
4. Świtoński M. (red.), „Postępy genetyki molekularnej bydła i trzody chlewnej”, Wydawnictwo AR, Poznań, 2004.
5. http://www.ncbi.nlm.nih.gov
Literatura uzupełniająca:
1. Misener S., Krawetz S.A., 2000 - Bioinformatics: Methods and Protocols. Humana Press
2. Brown S.M., 2000 - Bioinformatics: A Biologist's Guide to Biocomputing and the Internet. Eaton Pub Co
3. Higgins D., Taylor W., 2000 - Bioinformatics: Sequence, Structure and Databanks: A Practical Approach. Oxford University Press
4. Orengo C.A., 2003 - Bioinformatics: Genes, Proteins and Computers. Roultledge CRC Press/Taylor & Francis Group
5. Rashidi H., Buehler L.K., 2005 - Bioinformatics Basics: Applications in Biological Science and Medicine. CRC Press/Taylor & Francis Group
6. Pevsner et all., “Bioinformatics & Functional Genomics”, John Wiley & Sons, 2003
7. Campbell (red.) “Discovering Genomics Proteomics & Bioinformatics”, Benjamin/Cummings Publishing Co, 2002
8. S. Primrose. „Genomics”, Blackwell Science, 2003
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: